脐腐病是飞碟瓜的主要的心理性病害。普遍爆发，一样平常发病率在10%，严重时可达80%以上，对产量有显著的影响。

多在生长后期爆发，为害果实。发病时幼果坏死，或脐部泛起褐色凹陷，并向瓜柄扩展。最后整个瓜坏死腐败。

主要是水肥管理不当，田间突然缺水，湿度低，植株内大宗水分蒸发，瓜盘内水分倒流，使脐部组织坏死。偏施氮肥，造成缺钙，也是发病的因素之一。

充分验入有机肥，前期注重中耕和适当控水，要阻止草荒，着花前举行2～3次铲地松土，中耕除草，以增进根系发育。生育期内共追肥3次，第1次在缓苗后，第2次在盛花期，第3次在盛果期，追施稀粪水即可。